สรุป
12.000 ปีหลังจากเหตุการณ์ Sousei no Aquarion มนุษยชาติถูกคุกคามโดยศัตรูใหม่จากมิติอื่นที่มีชื่อว่า "Abductors" ซึ่งเหมือนกับ Shadow Angels บุกเมืองมนุษย์เพื่อลักพาตัวผู้อยู่อาศัย เพื่อปกป้องมนุษยชาติจากการรุกรานครั้งนี้องค์กร Neo-DEAVA ได้จัดตั้งทีมขึ้นสองทีมโดยทีมหนึ่งประกอบด้วยผู้ชายเพียงคนเดียวและอีกทีมเป็นผู้หญิงเท่านั้นโดยแต่ละทีมจะนำเครื่องจักรขนาดยักษ์ของตัวเองที่เรียกว่า "Aquaria" เพื่อปกป้องมิโคโนะเพื่อนใหม่ของเขาวัยรุ่นอมตะโซระจึงตัดสินใจใช้พลังที่เขาเก็บเป็นความลับมาตลอดชีวิตและด้วยการรวมเวกเตอร์กับนักบินชายและหญิงเข้าด้วยกันเป็นหุ่นยนต์ตัวเดียว Aquarion ยักษ์ในตำนานจึงเกิดใหม่อีกครั้ง